Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPIFP30405 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPIFP30405 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPIFP30405 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPIFP30405 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPIFP30405 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PPIFP30405 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms