Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD34P28906 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms