Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
APCP25054 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APCP25054 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APCP25054 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APCP25054 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APCP25054 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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