Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2P24941 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2P24941 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2P24941 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2P24941 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2P24941 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK2P24941 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms