Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms