Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL2P13500 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL2P13500 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms