Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR2C1P13056 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms