Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMP3P12645 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMP3P12645 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMP3P12645 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BMP3P12645 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BMP3P12645 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BMP3P12645 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms