Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms