Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms