Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms