Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms