Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR11A4FU01 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms