Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFR3BQ9Y2G0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFR3BQ9Y2G0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms