Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRXN1Q9ULB1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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