Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA3Q9UL41 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms