Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms