Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEPPQ9NTK1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEPPQ9NTK1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms