Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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