Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms