Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPEF2Q9C093 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms