Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms