Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms