Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-215ENST00000621029 934 ntTSL 528.3■■■□□ 2.126e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.636e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-211ENST00000612509 1061 ntTSL 517.75■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.346e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.246e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-207ENST00000441915 2710 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.236e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-214ENST00000619119 3158 ntTSL 515.46■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 30
TBRG4Q969Z0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 30
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TBRG4Q969Z0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 29.9
TBRG4Q969Z0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 29.8
TBRG4Q969Z0 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 29.8
TBRG4Q969Z0 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 29.8
TBRG4Q969Z0 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 29.8
TBRG4Q969Z0 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-9■■■■■ 29.8
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TBRG4Q969Z0 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 51.38□□□□□ -2.193e-7■■■■■ 29.8
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TBRG4Q969Z0 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 29.8
TBRG4Q969Z0 ZNF783-203ENST00000476295 2346 ntTSL 218.18■□□□□ 0.56e-6■■■■■ 29.8
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TBRG4Q969Z0 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 24.16□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 29.7
TBRG4Q969Z0 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.681e-9■■■■■ 29.7
TBRG4Q969Z0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 29.7
TBRG4Q969Z0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 29.7
TBRG4Q969Z0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 29.6
TBRG4Q969Z0 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 29.6
TBRG4Q969Z0 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 29.6
TBRG4Q969Z0 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 29.6
TBRG4Q969Z0 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.991e-6■■■■■ 29.6
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TBRG4Q969Z0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 KMT2D-203ENST00000547610 636 ntTSL 520.89■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 SLC7A6-208ENST00000564708 547 ntTSL 320.48■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-11■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 HEXA-214ENST00000569116 449 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 NOP56-213ENST00000480992 929 ntTSL 512.25□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.466e-8■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-11■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 RSRP1-218ENST00000568399 629 ntTSL 411.68□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 STRN3-203ENST00000366206 575 ntTSL 411.15□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 RBM25-209ENST00000531500 1039 ntTSL 310.96□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 RBM25-203ENST00000525321 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 MARF1-214ENST00000552553 5053 ntTSL 510.58□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 PIEZO2-212ENST00000582913 8465 ntTSL 510.58□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 HEXA-205ENST00000565873 721 ntTSL 210.16□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 59.53□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 29.4
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