Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms