Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms