Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms