Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC171Q6TFL3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms