Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC41PQ6P2S7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC41PQ6P2S7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms