Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms