Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SP6Q3SY56 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SP6Q3SY56 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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