Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms