Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms