Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms