Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms