Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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IRF4Q15306 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF4Q15306 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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