Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLINT1Q14677 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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