Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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