Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms