Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms