Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms