Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX1P83916 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX1P83916 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms