Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms