Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms