Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEMP55040 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEMP55040 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEMP55040 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEMP55040 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEMP55040 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEMP55040 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms