Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2A1P52655 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms