Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms