Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms