Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms