Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNKO75909 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms